Od počátku své mimořádně úspěšné vědecké kariéry zaměřené na oblast srdečního selhání byl vždy součástí předních vědeckých týmů, které posouvaly hranice oboru kardiologie.

Výjimečné výsledky prof. Jindřicha Špinara lze vysledovat již v 90. letech 20. století, kdy koordinoval první studie u srdečního selhání a infarktu myokardu.

Doposud nejvýznamnější klinický výzkum J. Špinara (Acute Heart Failure Database) je zaměřen na léčbu a prognózu pacientů po akutním srdečním selhání. Jedná se o dosud největší a nejdelší klinický průzkum svého druhu na světě a jeho výsledkem byl návrh nového systému, který zásadním způsobem pomáhá při stanovení prognózy nemocných s akutním srdečním selháním.

Své bohaté zkušenosti předává Jindřich Špinar studentům Lékařské fakulty MU, kde zejména jako školitel doktorských studentů formuje novou generaci vědců a lékařů oboru kardiologie.